Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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COL9A2Q14055 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COL9A2Q14055 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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