Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE7AQ13946 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms