Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2H2Q13888 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms