Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1SQ13698 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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