Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PTCH1Q13635 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTCH1Q13635 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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