Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CUL3Q13618 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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