Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF5Q13568 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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