Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PKD2Q13563 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKD2Q13563 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PKD2Q13563 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
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