Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCIRG1Q13488 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCIRG1Q13488 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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