Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SP140Q13342 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SP140Q13342 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SP140Q13342 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SP140Q13342 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SP140Q13342 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SP140Q13342 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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