Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRSQ13332 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms