Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SEMA3BQ13214 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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