Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DDX10Q13206 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX10Q13206 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
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