Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 23.3
TARDBPQ13148 DENND1A-211ENST00000491650 842 ntTSL 59.48□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 23.3
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TARDBPQ13148 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 23.3
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TARDBPQ13148 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 211.06□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 23.3
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TARDBPQ13148 FAM126A-205ENST00000440481 6337 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -12e-6■■■■□ 23.2
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