Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM32Q13049 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM32Q13049 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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