Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TROQ12816 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TROQ12816 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TROQ12816 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TROQ12816 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TROQ12816 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TROQ12816 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TROQ12816 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
TROQ12816 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TROQ12816 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TROQ12816 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TROQ12816 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TROQ12816 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TROQ12816 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
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