Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 ENV11YGR071C 2583 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 ALK1YGL021W 2283 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 PMR1YGL167C 2853 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 CAF120YNL278W 3183 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 INP51YIL002C 2841 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 YPP1YGR198W 2454 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 NMD2YHR077C 3270 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 snR81snR81 201 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 YDR521WYDR521W 336 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 MLH3YPL164C 2148 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 COX19YLL018C-A 297 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 CBF2YGR140W 2871 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 YLR278CYLR278C 4026 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 YLL020CYLL020C 306 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 MMS1YPR164W 4224 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 RIF1YBR275C 5751 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 NEW1YPL226W 3591 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 YNL018CYNL018C 1839 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 BUD2YKL092C 3315 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 snR62snR62 100 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 MOT1YPL082C 5604 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 FLO5YHR211W 3228 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 PKH2YOL100W 3246 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 RCO1YMR075W 2055 nt2.65□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 LHS1YKL073W 2646 nt2.65□□□□□ -1.98
TY1A-DR3Q12441 FLO1YAR050W 4614 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 SIN3YOL004W 4611 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 ATG11YPR049C 3537 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 SRB8YCR081W 4284 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 RAX2YLR084C 3663 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 HMI1YOL095C 2121 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 AMS1YGL156W 3252 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 MLH1YMR167W 2310 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 PNC1YGL037C 651 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 SEC7YDR170C 6030 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 DYN1YKR054C 12279 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 YPL150WYPL150W 2706 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 JSN1YJR091C 3276 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 NFT1YKR103W 3657 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 SEC63YOR254C 1992 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 SAP1YER047C 2694 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 UBP1YDL122W 2430 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 snR39BsnR39B 96 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-DR3Q12441 STB6YKL072W 2301 nt2.59□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 UBP15YMR304W 3693 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 NUP100YKL068W 2880 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 LCL1YPL056C 306 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 SPO14YKR031C 5052 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 TOM1YDR457W 9807 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 VPS8YAL002W 3825 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 BFR2YDR299W 1605 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 MDM1YML104C 3384 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 RPL37BYDR500C 267 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 COG4YPR105C 2586 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 MSH5YDL154W 2706 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 SLI15YBR156C 2097 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 YDL206WYDL206W 2289 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 SCP160YJL080C 3669 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 POL3YDL102W 3294 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 ECM29YHL030W 5607 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 AGC1YPR021C 2709 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 SEC26YDR238C 2922 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-DR3Q12441 ADR1YDR216W 3972 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 PRP8YHR165C 7242 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 BNR1YIL159W 4128 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 CTR9YOL145C 3234 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 MET18YIL128W 3099 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 FRK1YPL141C 2598 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 IST2YBR086C 2841 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 IRE1YHR079C 3348 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 TAH1YCR060W 336 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 YDR209CYDR209C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 RSE1YML049C 4086 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 RSM22YKL155C 1887 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 UFD2YDL190C 2886 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 TUS1YLR425W 3924 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 PET309YLR067C 2898 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 TBS1YBR150C 3285 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 TRS130YMR218C 3309 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 BPT1YLL015W 4680 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-DR3Q12441 SAP185YJL098W 3177 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 CDC60YPL160W 3273 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 YNL266WYNL266W 420 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 GCN2YDR283C 4980 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-DR3Q12441 BIR1YJR089W 2865 nt2.45□□□□□ -2.02
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