Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 NOP14YDL148C 2433 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 SRO77YBL106C 3033 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 HSH155YMR288W 2916 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 RPA190YOR341W 4995 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 KTI11YBL071W-A 249 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 YOR296WYOR296W 3870 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 SIN3YOL004W 4611 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 AXL1YPR122W 3627 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 SLH1YGR271W 5904 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 FLO11YIR019C 4104 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 ENV11YGR071C 2583 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 PHO91YNR013C 2685 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 MET6YER091C 2304 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 SKP2YNL311C 2292 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 YLL054CYLL054C 2532 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 IFH1YLR223C 3258 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 APL2YKL135C 2181 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 INP51YIL002C 2841 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 SAP190YKR028W 3102 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 POL3YDL102W 3294 nt2.49□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 TTI1YKL033W 3117 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 PRP8YHR165C 7242 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 CBF2YGR140W 2871 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 ATG11YPR049C 3537 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 PAU10YDR542W 363 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 PAU11YGL261C 363 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 PAU4YLR461W 363 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 CYR1YJL005W 6081 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 STE11YLR362W 2154 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 SMC6YLR383W 3345 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-NL1Q12391 ALK1YGL021W 2283 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YDR521WYDR521W 336 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YGL182CYGL182C 324 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 MMS22YLR320W 4365 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 IRC8YJL051W 2469 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 SAP1YER047C 2694 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 QCR9YGR183C 201 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 MAK10YEL053C 2202 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 SSN2YDR443C 4263 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 RCO1YMR075W 2055 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YPL216WYPL216W 3309 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 BUB1YGR188C 3066 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 ESL2YKR096W 3588 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 JSN1YJR091C 3276 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 NEW1YPL226W 3591 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 BCK1YJL095W 4437 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 NFT1YKR103W 3657 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 SRB8YCR081W 4284 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 APL1YJR005W 2103 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 MLH3YPL164C 2148 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 MRD1YPR112C 2664 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 snR81snR81 201 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 LHS1YKL073W 2646 nt2.4□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 RPO41YFL036W 4056 nt2.4□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 ISW1YBR245C 3390 nt2.4□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 AMS1YGL156W 3252 nt2.4□□□□□ -2.02
TY1A-NL1Q12391 LCL1YPL056C 306 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 YNL018CYNL018C 1839 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 UTP8YGR128C 2142 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 PKH2YOL100W 3246 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 MLH1YMR167W 2310 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 CAF120YNL278W 3183 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 HMI1YOL095C 2121 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 YDR209CYDR209C 414 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 STB6YKL072W 2301 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 BNR1YIL159W 4128 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 YPL150WYPL150W 2706 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 SEC26YDR238C 2922 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 UBP1YDL122W 2430 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 snR39BsnR39B 96 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 YLL020CYLL020C 306 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 SEC63YOR254C 1992 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 TOR1YJR066W 7413 nt2.35□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 MSH5YDL154W 2706 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1A-NL1Q12391 BUD2YKL092C 3315 nt2.34□□□□□ -2.03
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