Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 YBR174CYBR174C 315 nt1.41□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 YBP1YBR216C 2025 nt1.4□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 ZIP2YGL249W 2115 nt1.4□□□□□ -2.18
VAM3Q12241 VPS54YDR027C 2670 nt1.4□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.4□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.4□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 BIL1YOR304C-A 231 nt1.4□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 SLX4YLR135W 2247 nt1.4□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 ATG11YPR049C 3537 nt1.4□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YCS4YLR272C 3531 nt1.39□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YOR199WYOR199W 330 nt1.39□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 RIM20YOR275C 1986 nt1.39□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 KIP1YBL063W 3336 nt1.38□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 snR72snR72 98 nt1.38□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 RPS20YHL015W 366 nt1.38□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YOL160WYOL160W 342 nt1.38□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 PET127YOR017W 2403 nt1.38□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 FYV8YGR196C 2454 nt1.38□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 PMD1YER132C 5262 nt1.38□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 CCH1YGR217W 6120 nt1.37□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YLL054CYLL054C 2532 nt1.37□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 EST2YLR318W 2655 nt1.37□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 GIM4YEL003W 336 nt1.37□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.37□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.37□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 SCW11YGL028C 1629 nt1.37□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 SEC21YNL287W 2808 nt1.36□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 NPC2YDL046W 522 nt1.36□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 CSN9YDR179C 489 nt1.36□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.36□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.36□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YJL015CYJL015C 285 nt1.35□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YJL135WYJL135W 318 nt1.35□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 PCC1YKR095W-A 267 nt1.35□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.35□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YPR197CYPR197C 564 nt1.35□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YSY6YBR162W-A 198 nt1.35□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 MAD1YGL086W 2250 nt1.35□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 SPC110YDR356W 2835 nt1.34□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YDR426CYDR426C 378 nt1.34□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 COA6YMR244C-A 315 nt1.34□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.34□□□□□ -2.19
VAM3Q12241 AZF1YOR113W 2745 nt1.34□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 TRM732YMR259C 4263 nt1.33□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 YDL211CYDL211C 1119 nt1.33□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 snR14snR14 160 nt1.32□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 MSN5YDR335W 3675 nt1.32□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 RAD34YDR314C 2079 nt1.31□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 SLI15YBR156C 2097 nt1.31□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 NIP100YPL174C 2607 nt1.31□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.31□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 YLR255CYLR255C 354 nt1.31□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 TRM3YDL112W 4311 nt1.31□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 MPT5YGL178W 2580 nt1.3□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 YIL102CYIL102C 306 nt1.3□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 SWI4YER111C 3282 nt1.3□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 LCD1YDR499W 2244 nt1.3□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 SPT21YMR179W 2277 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 PIP2YOR363C 2991 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 ALY2YJL084C 3141 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 RPL35AYDL191W 363 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 HTB2YBL002W 396 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 POL5YEL055C 3069 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 AIM44YPL158C 2277 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 COG4YPR105C 2586 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 NUP188YML103C 4968 nt1.29□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.28□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 MAM33YIL070C 801 nt1.28□□□□□ -2.2
VAM3Q12241 ATP6Q0085 780 nt1.27□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YIR044CYIR044C 186 nt1.27□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.27□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 HKR1YDR420W 5409 nt1.26□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 RAD9YDR217C 3930 nt1.26□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 SPC98YNL126W 2541 nt1.26□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 RSM22YKL155C 1887 nt1.25□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 RRT15YLR162W-A 189 nt1.25□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 MMS4YBR098W 2076 nt1.25□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 PBY1YBR094W 2262 nt1.24□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 APL3YBL037W 3078 nt1.24□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 CUL3YGR003W 2235 nt1.24□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 CDC36YDL165W 576 nt1.24□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.24□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 PFD1YJL179W 330 nt1.24□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YPR063CYPR063C 423 nt1.24□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 IFH1YLR223C 3258 nt1.24□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 PKH2YOL100W 3246 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 CAT8YMR280C 4302 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 NUP145YGL092W 3954 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 NUP192YJL039C 5052 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YLL020CYLL020C 306 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YAR029WYAR029W 225 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 TAR1YLR154W-C 375 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YAF9YNL107W 681 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 MDS3YGL197W 4464 nt1.23□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 FIG4YNL325C 2640 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YDR102CYDR102C 333 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 GPG1YGL121C 381 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YJR011CYJR011C 786 nt1.22□□□□□ -2.21
VAM3Q12241 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.22□□□□□ -2.21
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