Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RASGEF1BQ0VAM2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms