Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EP300Q09472 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EP300Q09472 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EP300Q09472 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
EP300Q09472 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EP300Q09472 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EP300Q09472 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EP300Q09472 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EP300Q09472 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EP300Q09472 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EP300Q09472 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EP300Q09472 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EP300Q09472 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms