Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCBP1Q09161 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCBP1Q09161 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms