Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSRP1Q08945 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSRP1Q08945 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms