Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4CQ08493 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms