Protein–RNA interactions for Protein: Q07350

PRP11, Pre-mRNA-splicing factor PRP11, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP11Q07350 ILM1YJR118C 612 nt0.56□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 MRPL31YKL138C 396 nt0.56□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 ALY2YJL084C 3141 nt0.56□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 PDE2YOR360C 1581 nt0.56□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 RKR1YMR247C 4689 nt0.56□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 RIM20YOR275C 1986 nt0.56□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 SLY1YDR189W 2001 nt0.55□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 LCD1YDR499W 2244 nt0.55□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 YDL016CYDL016C 303 nt0.55□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.55□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 SVS1YPL163C 783 nt0.55□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 SWI6YLR182W 2412 nt0.55□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 RFX1YLR176C 2436 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 OCA6YDR067C 675 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 QCR9YGR183C 201 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 URM1YIL008W 300 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 UBX4YMR067C 1251 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 RRT1YBL048W 312 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 SNU56YDR240C 1479 nt0.54□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 YCK3YER123W 1575 nt0.53□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 SWF1YDR126W 1011 nt0.53□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.53□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 YGR025WYGR025W 303 nt0.53□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 MMS4YBR098W 2076 nt0.53□□□□□ -2.32
PRP11Q07350 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.52□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YFL012WYFL012W 447 nt0.52□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YIL059CYIL059C 366 nt0.52□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 APQ13YJL075C 417 nt0.52□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 snR13snR13 124 nt0.52□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 UTP10YJL109C 5310 nt0.51□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 MET32YDR253C 576 nt0.51□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YGL239CYGL239C 315 nt0.51□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YGR042WYGR042W 816 nt0.51□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YNL319WYNL319W 441 nt0.51□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 RCN2YOR220W 798 nt0.51□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 NPC2YDL046W 522 nt0.5□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 snR78snR78 87 nt0.5□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YDR269CYDR269C 324 nt0.5□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.5□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YPR153WYPR153W 423 nt0.5□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 WAR1YML076C 2835 nt0.49□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 SLI15YBR156C 2097 nt0.49□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 IES4YOR189W 351 nt0.49□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 TSC3YBR058C-A 243 nt0.49□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YOL014WYOL014W 375 nt0.48□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 YDR029WYDR029W 315 nt0.47□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 ALG13YGL047W 609 nt0.47□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.47□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 RPL38YLR325C 237 nt0.47□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 GEA2YEL022W 4380 nt0.47□□□□□ -2.33
PRP11Q07350 DBP6YNR038W 1890 nt0.46□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.46□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.46□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 WIP1YDR374W-A 270 nt0.46□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 ZIP2YGL249W 2115 nt0.46□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.45□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.45□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 LTE1YAL024C 4308 nt0.45□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 ISD11YER048W-A 285 nt0.44□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YKL123WYKL123W 381 nt0.44□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YOR218CYOR218C 420 nt0.44□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 BFR2YDR299W 1605 nt0.44□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 EFR3YMR212C 2349 nt0.43□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YLL007CYLL007C 1998 nt0.43□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 ECM12YHR021W-A 456 nt0.43□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 GPG1YGL121C 381 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 RPL9AYGL147C 576 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YJL135WYJL135W 318 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 ISF1YMR081C 1017 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 GPI15YNL038W 690 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YPL182CYPL182C 384 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 LOA1YPR139C 903 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 PAN2YGL094C 3348 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 ULP2YIL031W 3105 nt0.42□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YCR001WYCR001W 315 nt0.41□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.41□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 BIG1YHR101C 1008 nt0.41□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 NFU1YKL040C 771 nt0.41□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 RPS27AYKL156W 249 nt0.41□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 TRS65YGR166W 1683 nt0.4□□□□□ -2.34
PRP11Q07350 YHL042WYHL042W 453 nt0.4□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 RPF1YHR088W 888 nt0.4□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 YLR269CYLR269C 351 nt0.4□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.4□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 RPB10YOR210W 213 nt0.39□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 AI1Q0050 2505 nt0.39□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 PKH2YOL100W 3246 nt0.38□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 TIM13YGR181W 318 nt0.38□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 YOR282WYOR282W 321 nt0.38□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 FMP27YLR454W 7887 nt0.38□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 CHS6YJL099W 2241 nt0.37□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 snR72snR72 98 nt0.37□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 YDR344CYDR344C 444 nt0.37□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 YKL202WYKL202W 582 nt0.37□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.37□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 YOL160WYOL160W 342 nt0.37□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 NOP9YJL010C 2001 nt0.37□□□□□ -2.35
PRP11Q07350 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.36□□□□□ -2.35
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