Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CKAP4Q07065 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms