Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms