Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXOSC9Q06265 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms