Protein–RNA interactions for Protein: Q04511

UFO1, Ubiquitin ligase complex F-box protein UFO1, yeastyeast

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFO1Q04511 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.12□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 RPS17AYML024W 411 nt2.12□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 YOL160WYOL160W 342 nt2.12□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 YPR092WYPR092W 306 nt2.12□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 SEC31YDL195W 3822 nt2.12□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 MMS22YLR320W 4365 nt2.12□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 Q0092Q0092 141 nt2.11□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 VPS55YJR044C 423 nt2.11□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.11□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 RRT15YLR162W-A 189 nt2.11□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.1□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.1□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 UBP2YOR124C 3819 nt2.1□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 YMR045CYMR045C 5268 nt2.1□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 SPC98YNL126W 2541 nt2.1□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 RGA1YOR127W 3024 nt2.09□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 GIP3YPL137C 3831 nt2.09□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 NOP14YDL148C 2433 nt2.09□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 USO1YDL058W 5373 nt2.09□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 YJL150WYJL150W 303 nt2.09□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 FKS1YLR342W 5631 nt2.09□□□□□ -2.07
UFO1Q04511 TUS1YLR425W 3924 nt2.09□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 RTT101YJL047C 2529 nt2.09□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 VPS8YAL002W 3825 nt2.08□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 ZRG17YNR039C 1818 nt2.08□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 snR74snR74 88 nt2.08□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 OLI1Q0130 231 nt2.08□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YNL338WYNL338W 159 nt2.08□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 SEC5YDR166C 2916 nt2.07□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YEL014CYEL014C 306 nt2.07□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 CHC1YGL206C 4962 nt2.07□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 HER1YOR227W 3741 nt2.07□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 NEO1YIL048W 3456 nt2.06□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 UBP1YDL122W 2430 nt2.06□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 SRP14YDL092W 441 nt2.06□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YBL012CYBL012C 402 nt2.06□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.06□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 GYP5YPL249C 2685 nt2.06□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.05□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 RPS27BYHR021C 249 nt2.05□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.05□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 SPO75YLL005C 2607 nt2.05□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 PUT3YKL015W 2940 nt2.05□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.05□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.04□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YDL118WYDL118W 381 nt2.04□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YOR376WYOR376W 369 nt2.04□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 SGF11YPL047W 300 nt2.04□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 SIR4YDR227W 4077 nt2.04□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YKU70YMR284W 1809 nt2.03□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 TRS65YGR166W 1683 nt2.03□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 HSH155YMR288W 2916 nt2.03□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YLR140WYLR140W 327 nt2.03□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.03□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 YOR218CYOR218C 420 nt2.03□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 TRL1YJL087C 2484 nt2.03□□□□□ -2.08
UFO1Q04511 PRP39YML046W 1890 nt2.03□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YDR341CYDR341C 1824 nt2.03□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 TFC8YPL007C 1767 nt2.03□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.02□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.02□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 MGA2YIR033W 3342 nt2.02□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 ZIP1YDR285W 2628 nt2.02□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 LHS1YKL073W 2646 nt2.02□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 TMA7YLR262C-A 195 nt2.01□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.01□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 MSC6YOR354C 2079 nt2.01□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 CAT2YML042W 2013 nt2.01□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 ENV11YGR071C 2583 nt2.01□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 RLM1YPL089C 2031 nt2□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 ATG11YPR049C 3537 nt2□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YGL217CYGL217C 342 nt2□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 RPL34BYIL052C 366 nt2□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 SPO21YOL091W 1830 nt2□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 REV3YPL167C 4515 nt1.99□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 NAM7YMR080C 2916 nt1.99□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 ZIP2YGL249W 2115 nt1.99□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 SYH1YPL105C 2550 nt1.99□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.99□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 CDC60YPL160W 3273 nt1.99□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 DCP2YNL118C 2913 nt1.99□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 RAD34YDR314C 2079 nt1.98□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YJL120WYJL120W 324 nt1.98□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 RTT107YHR154W 3213 nt1.98□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 MCM10YIL150C 1716 nt1.97□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 SAS3YBL052C 2496 nt1.97□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 MAK10YEL053C 2202 nt1.97□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.97□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 RPL37BYDR500C 267 nt1.97□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 MSH5YDL154W 2706 nt1.97□□□□□ -2.09
UFO1Q04511 ATP8Q0080 147 nt1.96□□□□□ -2.1
UFO1Q04511 RPS25BYLR333C 327 nt1.96□□□□□ -2.1
UFO1Q04511 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.96□□□□□ -2.1
UFO1Q04511 YBR174CYBR174C 315 nt1.96□□□□□ -2.1
UFO1Q04511 GCN2YDR283C 4980 nt1.96□□□□□ -2.1
UFO1Q04511 APL2YKL135C 2181 nt1.96□□□□□ -2.1
UFO1Q04511 HSL1YKL101W 4557 nt1.95□□□□□ -2.1
UFO1Q04511 MAD1YGL086W 2250 nt1.95□□□□□ -2.1
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