Protein–RNA interactions for Protein: Q03330

GCN5, Histone acetyltransferase GCN5, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN5Q03330 YJL120WYJL120W 324 nt2.48□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 SNC1YAL030W 354 nt2.48□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.48□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 YBR277CYBR277C 402 nt2.48□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 MNE1YOR350C 1992 nt2.48□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 AFI1YOR129C 2682 nt2.48□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 YDR341CYDR341C 1824 nt2.47□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 SGM1YJR134C 2124 nt2.47□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 RPS25BYLR333C 327 nt2.47□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 LYS14YDR034C 2373 nt2.47□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 VPS16YPL045W 2397 nt2.47□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 CRM1YGR218W 3255 nt2.46□□□□□ -2.01
GCN5Q03330 TRA1YHR099W 11235 nt2.46□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 TOP2YNL088W 4287 nt2.46□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.46□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 SMY2YBR172C 2223 nt2.46□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 GIS1YDR096W 2685 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 ISW1YBR245C 3390 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 MLH1YMR167W 2310 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 HAL9YOL089C 3093 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 PAU3YCR104W 375 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 PHO91YNR013C 2685 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 APL5YPL195W 2799 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 FIG4YNL325C 2640 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 DUG2YBR281C 2637 nt2.45□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 RGA2YDR379W 3030 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 IRR1YIL026C 3453 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 YCR043CYCR043C 384 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 EMP24YGL200C 612 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 ACB1YGR037C 264 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 PAU8YAL068C 363 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 PAU18YLL064C 363 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 KTI11YBL071W-A 249 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 PAU6YNR076W 363 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 PAU20YOL161C 363 nt2.44□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 ARP8YOR141C 2646 nt2.43□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 STE11YLR362W 2154 nt2.43□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 MSB1YOR188W 3414 nt2.43□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.43□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 FIR1YER032W 2631 nt2.43□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 SDC25YLL016W 3147 nt2.43□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 SLM1YIL105C 2061 nt2.42□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 ATP7YKL016C 525 nt2.42□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 YBR099CYBR099C 384 nt2.42□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 PUT3YKL015W 2940 nt2.42□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 SET2YJL168C 2202 nt2.42□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 RRP6YOR001W 2202 nt2.42□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 AIM44YPL158C 2277 nt2.42□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 MRD1YPR112C 2664 nt2.41□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 RLM1YPL089C 2031 nt2.41□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 GCV2YMR189W 3105 nt2.41□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 SSN2YDR443C 4263 nt2.4□□□□□ -2.02
GCN5Q03330 YPL044CYPL044C 549 nt2.4□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 YCL046WYCL046W 324 nt2.4□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 MGM1YOR211C 2646 nt2.39□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 CRS5YOR031W 210 nt2.39□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 AHC1YOR023C 1701 nt2.39□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 ZRG8YER033C 3231 nt2.38□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 snR61snR61 90 nt2.38□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.38□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 NUP170YBL079W 4509 nt2.38□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 SPF1YEL031W 3648 nt2.38□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 RPL31AYDL075W 342 nt2.37□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.37□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 YEF3YLR249W 3135 nt2.37□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 RAD34YDR314C 2079 nt2.37□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 CAT2YML042W 2013 nt2.36□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 PAA1YDR071C 576 nt2.36□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 PIP2YOR363C 2991 nt2.36□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 NOC3YLR002C 1992 nt2.36□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 INP53YOR109W 3324 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 ZRG17YNR039C 1818 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 PBY1YBR094W 2262 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 TOR1YJR066W 7413 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 FAR11YNL127W 2862 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 CDC53YDL132W 2448 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 RPS29AYLR388W 171 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 ZIP2YGL249W 2115 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 NAM7YMR080C 2916 nt2.35□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 KRE33YNL132W 3171 nt2.34□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 SCD5YOR329C 2619 nt2.34□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 SBH1YER087C-B 249 nt2.34□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.34□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 CDC31YOR257W 486 nt2.34□□□□□ -2.03
GCN5Q03330 INP51YIL002C 2841 nt2.33□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 IRA2YOL081W 9240 nt2.33□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.33□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 CTF4YPR135W 2784 nt2.33□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 CBF2YGR140W 2871 nt2.33□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 YOL098CYOL098C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 UBP1YDL122W 2430 nt2.32□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 HOS4YIL112W 3252 nt2.31□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.31□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 HSH155YMR288W 2916 nt2.3□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 CMC4YMR194C-B 222 nt2.3□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 SLD3YGL113W 2007 nt2.3□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 MAD1YGL086W 2250 nt2.3□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 NOP14YDL148C 2433 nt2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 91 ms