Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARDQ03181 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARDQ03181 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms