Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPL6Q02878 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL6Q02878 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms