Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XPCQ01831 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XPCQ01831 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
XPCQ01831 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XPCQ01831 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
XPCQ01831 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XPCQ01831 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
XPCQ01831 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
XPCQ01831 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPCQ01831 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPCQ01831 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPCQ01831 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPCQ01831 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPCQ01831 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPCQ01831 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
XPCQ01831 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms