Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms