Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms