Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX1P83916 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX1P83916 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX1P83916 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX1P83916 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX1P83916 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms