Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP5P82980 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBP5P82980 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBP5P82980 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBP5P82980 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBP5P82980 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBP5P82980 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBP5P82980 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBP5P82980 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBP5P82980 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBP5P82980 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBP5P82980 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBP5P82980 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBP5P82980 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBP5P82980 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms