Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMF1P82094 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMF1P82094 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMF1P82094 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMF1P82094 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMF1P82094 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMF1P82094 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMF1P82094 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMF1P82094 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMF1P82094 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMF1P82094 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMF1P82094 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMF1P82094 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TMF1P82094 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMF1P82094 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMF1P82094 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMF1P82094 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMF1P82094 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMF1P82094 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms