Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HERVK_113P63121 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms