Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VBP1P61758 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VBP1P61758 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VBP1P61758 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VBP1P61758 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VBP1P61758 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms