Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB2AP61019 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms