Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX10P56693 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX10P56693 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX10P56693 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX10P56693 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX10P56693 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX10P56693 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX10P56693 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX10P56693 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX10P56693 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX10P56693 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX10P56693 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX10P56693 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX10P56693 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms