Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms