Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNA2D1P54289 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms