Protein–RNA interactions for Protein: P53758

YNR077C, UPF0320 protein YNR077C, yeastyeast

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNR077CP53758 SLD3YGL113W 2007 nt0.62□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YHR125WYHR125W 306 nt0.61□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 WAR1YML076C 2835 nt0.61□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.6□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YPR153WYPR153W 423 nt0.6□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 COG4YPR105C 2586 nt0.6□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YJR003CYJR003C 1560 nt0.59□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YDL158CYDL158C 309 nt0.59□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.59□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.59□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.59□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 YBL071CYBL071C 309 nt0.59□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 RPB10YOR210W 213 nt0.59□□□□□ -2.31
YNR077CP53758 IML1YJR138W 4755 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YDL011CYDL011C 324 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YDL196WYDL196W 330 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 GPG1YGL121C 381 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 AIM29YKR074W 468 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YLR287CYLR287C 1068 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 ZEO1YOL109W 342 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YBL108WYBL108W 306 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 snR54snR54 86 nt0.58□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 PAN2YGL094C 3348 nt0.57□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YJL135WYJL135W 318 nt0.57□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 HCH1YNL281W 462 nt0.57□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 CDC33YOL139C 642 nt0.57□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 BUD3YCL014W 4911 nt0.57□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 SEC1YDR164C 2175 nt0.57□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YAR009CYAR009C 3591 nt0.57□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 BI2Q0110 1272 nt0.56□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 ALG13YGL047W 609 nt0.56□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YNL122CYNL122C 348 nt0.56□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 IES4YOR189W 351 nt0.56□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 PKH2YOL100W 3246 nt0.55□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 DBP6YNR038W 1890 nt0.55□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 NHP2YDL208W 471 nt0.55□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 WIP1YDR374W-A 270 nt0.55□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 ISD11YER048W-A 285 nt0.55□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 DIE2YGR227W 1578 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YGR042WYGR042W 816 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 ECL1YGR146C 636 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YGR290WYGR290W 444 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YOL160WYOL160W 342 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YPL261CYPL261C 309 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 TTI1YKL033W 3117 nt0.54□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.53□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 YPL229WYPL229W 621 nt0.53□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 LOA1YPR139C 903 nt0.53□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 snR51snR51 107 nt0.53□□□□□ -2.32
YNR077CP53758 SWF1YDR126W 1011 nt0.52□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YDR521WYDR521W 336 nt0.52□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 RTT102YGR275W 474 nt0.52□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YLR171WYLR171W 390 nt0.52□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.52□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 RAD34YDR314C 2079 nt0.51□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 GEA2YEL022W 4380 nt0.51□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 CUL3YGR003W 2235 nt0.51□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YHL042WYHL042W 453 nt0.51□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 PAC1YOR269W 1485 nt0.51□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YOR282WYOR282W 321 nt0.51□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.51□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 snR72snR72 98 nt0.5□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YIR044CYIR044C 186 nt0.5□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.5□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.5□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YNL058CYNL058C 951 nt0.5□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 REV3YPL167C 4515 nt0.49□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.49□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.49□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 FYV7YLR068W 456 nt0.49□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 CMC4YMR194C-B 222 nt0.49□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.49□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 INP2YMR163C 2118 nt0.49□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YDL073WYDL073W 2955 nt0.48□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 SDH7YDR511W 402 nt0.48□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YML003WYML003W 873 nt0.48□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.48□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 snR189snR189 189 nt0.48□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 ECM12YHR021W-A 456 nt0.47□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YKL083WYKL083W 615 nt0.47□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 YLR101CYLR101C 396 nt0.47□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 RKR1YMR247C 4689 nt0.47□□□□□ -2.33
YNR077CP53758 CBS1YDL069C 690 nt0.46□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YHL041WYHL041W 450 nt0.46□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YAR047CYAR047C 321 nt0.46□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 BFR2YDR299W 1605 nt0.46□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YLL007CYLL007C 1998 nt0.45□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.45□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 snR41snR41 95 nt0.45□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 PTP2YOR208W 2253 nt0.45□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.44□□□□□ -2.34
YNR077CP53758 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms