Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.14□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YKL111CYKL111C 336 nt0.14□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.14□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YPL197CYPL197C 414 nt0.14□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YHR054CYHR054C 1065 nt0.13□□□□□ -2.39
SNT2P53127 IPI3YNL182C 1668 nt0.13□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.13□□□□□ -2.39
SNT2P53127 LRP1YHR081W 555 nt0.13□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.13□□□□□ -2.39
SNT2P53127 TFB5YDR079C-A 219 nt0.12□□□□□ -2.39
SNT2P53127 SBH1YER087C-B 249 nt0.12□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YDR008CYDR008C 351 nt0.11□□□□□ -2.39
SNT2P53127 RPC10YHR143W-A 213 nt0.11□□□□□ -2.39
SNT2P53127 LIN1YHR156C 1023 nt0.11□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YNL150WYNL150W 408 nt0.11□□□□□ -2.39
SNT2P53127 MRPL50YNR022C 420 nt0.11□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YBR071WYBR071W 636 nt0.11□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YLR232WYLR232W 348 nt0.1□□□□□ -2.39
SNT2P53127 YLL032CYLL032C 2478 nt0.09□□□□□ -2.39
SNT2P53127 SPO11YHL022C 1197 nt0.09□□□□□ -2.4
SNT2P53127 CUP1-1YHR053C 186 nt0.09□□□□□ -2.4
SNT2P53127 CUP1-2YHR055C 186 nt0.09□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.09□□□□□ -2.4
SNT2P53127 MRPL31YKL138C 396 nt0.08□□□□□ -2.4
SNT2P53127 NOP9YJL010C 2001 nt0.08□□□□□ -2.4
SNT2P53127 PMP1YCR024C-A 123 nt0.07□□□□□ -2.4
SNT2P53127 NPC2YDL046W 522 nt0.07□□□□□ -2.4
SNT2P53127 EMC4YGL231C 573 nt0.07□□□□□ -2.4
SNT2P53127 TIM10YHR005C-A 282 nt0.07□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.07□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YDR220CYDR220C 294 nt0.06□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YDR344CYDR344C 444 nt0.06□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.06□□□□□ -2.4
SNT2P53127 TFB6YOR352W 1032 nt0.06□□□□□ -2.4
SNT2P53127 BI4Q0120 1917 nt0.06□□□□□ -2.4
SNT2P53127 RAD34YDR314C 2079 nt0.05□□□□□ -2.4
SNT2P53127 PET111YMR257C 2403 nt0.05□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YLR217WYLR217W 324 nt0.04□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YLR252WYLR252W 306 nt0.04□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YBL062WYBL062W 381 nt0.04□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.04□□□□□ -2.4
SNT2P53127 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.04□□□□□ -2.4
SNT2P53127 GPG1YGL121C 381 nt0.04□□□□□ -2.4
SNT2P53127 VAM3YOR106W 852 nt0.04□□□□□ -2.4
SNT2P53127 AFR1YDR085C 1863 nt0.03□□□□□ -2.4
SNT2P53127 MLP1YKR095W 5628 nt0.03□□□□□ -2.4
SNT2P53127 CMC1YKL137W 336 nt0.03□□□□□ -2.41
SNT2P53127 CDC33YOL139C 642 nt0.03□□□□□ -2.41
SNT2P53127 RFX1YLR176C 2436 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YFR057WYFR057W 456 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 BIG1YHR101C 1008 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YLR271WYLR271W 825 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YPR096CYPR096C 303 nt0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 URB1YKL014C 5295 nt0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YGR164WYGR164W 336 nt0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YHL042WYHL042W 453 nt0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 LOA1YPR139C 903 nt0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 snR5snR5 204 nt0□□□□□ -2.41
SNT2P53127 COX12YLR038C 252 nt0□□□□□ -2.41
SNT2P53127 RPL26AYLR344W 384 nt0□□□□□ -2.41
SNT2P53127 VIK1YPL253C 1944 nt-0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 BUD26YDR241W 288 nt-0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YJR079WYJR079W 330 nt-0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 BSC3YLR465C 309 nt-0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YOR053WYOR053W 342 nt-0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 snR46snR46 197 nt-0.01□□□□□ -2.41
SNT2P53127 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YGL015CYGL015C 393 nt-0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 VMA21YGR105W 234 nt-0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 SDS22YKL193C 1017 nt-0.02□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.03□□□□□ -2.41
SNT2P53127 CWC23YGL128C 852 nt-0.03□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.03□□□□□ -2.41
SNT2P53127 FYV10YIL097W 1551 nt-0.03□□□□□ -2.41
SNT2P53127 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-0.04□□□□□ -2.42
SNT2P53127 YNR077CYNR077C 255 nt-0.04□□□□□ -2.42
SNT2P53127 YGR228WYGR228W 345 nt-0.04□□□□□ -2.42
SNT2P53127 CSM4YPL200W 471 nt-0.04□□□□□ -2.42
SNT2P53127 YDR269CYDR269C 324 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNT2P53127 RCN2YOR220W 798 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNT2P53127 YPL044CYPL044C 549 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNT2P53127 INP2YMR163C 2118 nt-0.06□□□□□ -2.42
SNT2P53127 PRP42YDR235W 1635 nt-0.07□□□□□ -2.42
SNT2P53127 CUL3YGR003W 2235 nt-0.08□□□□□ -2.42
SNT2P53127 YJL135WYJL135W 318 nt-0.08□□□□□ -2.42
SNT2P53127 YGR115CYGR115C 780 nt-0.09□□□□□ -2.42
SNT2P53127 YOR248WYOR248W 303 nt-0.09□□□□□ -2.42
SNT2P53127 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT2P53127 ILM1YJR118C 612 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YNL050CYNL050C 813 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YBR064WYBR064W 429 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT2P53127 snR190snR190 190 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YCL002CYCL002C 792 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT2P53127 MCM10YIL150C 1716 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT2P53127 PRP5YBR237W 2550 nt-0.1□□□□□ -2.43
SNT2P53127 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.11□□□□□ -2.43
SNT2P53127 SSS1YDR086C 243 nt-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.5 ms