Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCN3P51790 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms