Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SMARCA2P51531 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SMARCA2P51531 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms