Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK7P50613 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK7P50613 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK7P50613 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK7P50613 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK7P50613 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK7P50613 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms