Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CASP4P49662 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP4P49662 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP4P49662 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP4P49662 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CASP4P49662 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP4P49662 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP4P49662 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms